Si por casualidades de la vida instalaste primero el Visual Studio NET y luego el IIS , te habrás dado cuenta que no te deja crear aplicaciones AspNet. Esto es porque los Componentes que se requieren no fueron instalados en el Internet Information Server. Para resolver este problema prueba lo siguiente: Ejecutar el archivo aspnet_regiis.exe con el parámetro -i.
c:\WINNT\Microsoft.NET\Framework\v1.0.3705\aspnet_regiis.exe -i.
